民進黨立院黨團5日指控國民黨新竹市長參選人林耕仁的陽明交大碩士論文涉抄襲，林耕仁昨天下午3時火速備妥相關文件資料，親自到陽明交大遞交管理碩士論文及資料自清，申請學倫會啟動調查。陽明交大表示將依規定啟動處理程序，並將自今起120天內作出結論。
林耕仁擁有交通大學、中華大學雙碩士學位，論文主題為中華大學科技管理研究所2004年出版《地區性民代的選民服務及滿意度調查之研究-以新竹市為例》，以及交通大學高階主管管理碩士學程，在2010年出版《新竹市現況分析及未來發展建議-以治安、交通及觀光為例》。
民進黨團副書記長林楚茵指出，林耕仁的交大碩論剪貼10份新竹市政府的統計專案報告；立委林靜儀則說，林耕仁以議員身分拿到不公開的政府資料，她預先說「學校的學術審查不容易比對出來」。
林耕仁則提出4點聲明澄清，強調引用的資料都是政府的公開資訊，且註明出處，並非抄襲，4點聲明包括請民進黨不要轉移陳時中偷窺廣告的焦點，不要為了拯救沈慧虹低迷的選情，選舉要回歸政策願景而不是潑髒水；論文是他針對新竹市民關心的交通、治安狀況進行研究；論文因針對現況分析，文獻探討引用政府資料分析，但都有註明出處，並非抄襲，惟有6處疏漏引註，自承是失誤，會虛心檢討；會主動送交陽明交大學倫會調查，捍衛清白。林耕仁強調，論文或許寫得不好，但絕非抄襲。
民進黨新竹市長參選人沈慧虹表示，建議林耕仁應用同等標準要求自己。民眾黨新竹市長參選人高虹安肯定林耕仁主動繳送資料到陽明交大做法。 陽明交大昨午證實收到檢舉書，將依規迅速啟動處理程序。校方說明，形式要件審查小組確認成立檢舉案後，學院將籌組專業學術領域調查小組，120天內作出結論，也會一併處理指導教授是否監督不周。
（中國時報／陳育賢、王惠慧、葉家瑋）