武漢華南海鮮市場一直被認為是此次新冠肺炎發源地,但現在開始被推翻。中國科學院團隊以基因追蹤「零號病人」,即第一批最早在去年12月1日被發現的41個確診病例,其中有13個病例與海鮮市場無接觸史。也就是說,海鮮市場的新型冠狀病毒是從其它地方傳入。
中國科學院西雙版納熱帶植物園聯合華南農業大學和北京腦科中心收集全球共用到GISAID EpiFluTM資料庫中覆蓋四大洲12個國家的93個新冠病毒樣本基因組資料(截至2月12日),透過基因組資料解析發現:華南海鮮市場的新冠病毒是從其它地方傳入。
93個樣本包含58種單倍型,演化關係顯示,單倍型H13和H38是比較古老的單倍型,透過一個中間載體(mv1,可能是祖先單倍型,也可能是來自中間宿主或「零號病人」)與蝙蝠冠狀病毒RaTG13關聯,並通過單倍型H3衍生出單倍型H1。
研究人員稱,與華南海鮮市場有關聯的患者樣品單倍型都是H1及其衍生單倍型H2、H8-H12,而一份武漢樣本單倍型H3與華南海鮮市場無關,可見華南海鮮市場的新冠病毒是從其它地方傳入,再於市場發生快速傳播並蔓延。
研究還顯示,新冠病毒在2月12日前發生過2次明顯種群擴張:一次是2019年12月8日,該結果暗示病毒可能在12月初,甚至11月下旬已開始人際傳播,隨後在華南海鮮市場加快;另一次種群擴張發生在1月6日。
為細分來源,研究人員將58種單倍型分成五組,包括3個古老超級傳播者單倍型(H1、H3和H13)和2名新的超級傳播者單倍型(H56和mv2),以此鑒別出廣東的病毒可能有三個來源,重慶和台灣的病毒有兩個來源,尤其是美國包括了五個來源。
特別值得關注的是,H56這個超級傳播者單倍型,同時是澳洲、法國和美國及台灣患者的傳染源。
(記者/林勁傑)