台北地檢署偵辦新竹市長當選人、立委高虹安涉詐領助理費案，15日搜索她的立院辦公室等8處，因正值立法院會期間，檢調動作引起不尊重國會的批評，立法院長游錫堃稱，北檢曾事先函請同意搜索，16日卻被北檢「打臉」，指當天僅由北檢檢察長打電話告知祕書長，並無函請立院同意搜索。
民眾黨發言人徐千晴指出，這問題真的要問游錫堃與檢調，為何才事發一天，記憶與說法會有出入，導致事件出現多個版本，呼籲相關當事人應說明清楚，才不會讓國人對司法產生疑慮。
柯文哲批檢方動作大 違反比例原則
甫結束新加坡參訪行程歸國的民眾黨主席、台北市長柯文哲昨晚在機場受訪則表示，司法是國家最後一道防線，他希望台灣的司法是可以被相信，但整件事已明顯違反比例原則；他很疑惑，在國會開議期間，檢調還如此大動作搜索，「到底新竹市有什麼不能見人的事？」整件事他覺得「怪怪的」。
游錫堃15日說，有關搜索一事，司法單位日前已事先通知，他在幾天前批准，「檢調依法通知，立院就依法配合」，但16日北檢發新聞稿指出，當天檢察長先以電話通知立法院祕書長，並陳報游院長後，再由院方人員引領執行人員前往高姓被告國會辦公室搜索，並無事先函請立法院同意搜索。
立法院解釋，院長原以為媒體所問的是調閱資料一事，誤以為日前簽署的公文包含搜索一事，才會這樣回應。不過，外界質疑為什麼會將調閱資料和搜索混為一談？難道是有先見之明或預設立場，加上搜索期間正值立法院會期，實在少見。
2000年廖福本案 王金平曾嚴正抗議
檢方表示，2000年8月台南地檢署偵辦時任立委廖福本奇美假股票案，搜索廖立法院研究室和大安會館住處，創下檢調辦案首度搜索立法院院區的例子，卻引起爭議。當時立法院長王金平認為檢調未通知立法院，發表嚴正聲明抗議，事後法務部規定檢察機關，搜索立法院前必須先知會立法院。
此後檢調因辦案需要搜索立法院，都先知會立法院行政事務的最高首長，即立法院法定代表人的祕書長，請其陳報立法院長；僅2016年檢調偵辦時任立法院祕書長林錫山貪汙案，因林本身是被偵辦對象，才「跳過」林，直接知會當時的院長王金平。
不過，國民黨立委陳玉珍認為，游錫堃簽公文時可能沒認真看，但重點在於，中華民國是五權分立國家，檢調是否能大動作到立法院搜索、粗暴對待國會議員，真的有待商榷，此舉恐造成憲政慣例，且對國家法治有深遠影響。
賴士葆質疑立法院 配合得「太詭異」
國民黨立委賴士葆也質疑，過去立法院會捍衛尊嚴，在休會期間處理這件事更好，「擔心以後被消滅證據的說法有點薄弱，我們看到的是秋後算帳、司法追殺的味道濃厚，但我們尊重司法，希望勿枉勿縱，只是時機點實在太詭異，且立法院的配合也太詭異。」
施明德昨天凌晨在臉書發文，他受訪指出不認識高虹安，但是看到發生這種事，氣到睡不著覺。他痛批游錫堃，「這麼輕率一句『尊重司法』就搪塞過去」、「游錫堃一生就是這樣，凡事只會尊重長官」，這次是嚴重失職，身為立法院長，要捍衛立法院尊嚴，保障立委人身安全，竟然放任檢調突圍，懦弱無視憲法規範，讓司法檢調踐踏蹂躪立法院尊嚴。
民進黨立委鄭運鵬說，檢調不辦才是失職，如果真的要做政治偵辦，對議員、對選舉都會有很大影響，「檢調是獨立辦案，選前辦反而爭議大，但選後辦又說是秋後算帳，那就不辦了嗎？」
政大法律系教授廖元豪表示，《刑事訴訟法》第149條規定，搜索政府機關必須先知會機關長官，因此形式上沒有任何法律禁止搜索，但要尊重立委行使職權，搜索確實很侵入立委職權的範圍，雖然法律沒禁止，但在必要範圍和比例原則下，除非是萬得不已，不會去搜索。(中時/游念育、曾薏蘋、陳志賢)