工商協進會的建議財政部針對企業特定股權交易標準，應該排除104年以前所取得的房地，以利企業IPO以及永續經營，財政部回應評估其必要性與合理性。
工商協進會的提案中表明，房地合一稅2.0的規定，個人或者相關營利事業出售投資的營利事業，股份或者出資額直接或間接所持有超過一半，交易時該營利事業價值的50％以上，是由我國境內的房地，就要算入房地合一課稅。
工商協進會表示，台灣許多企業早年因應生產需要，名下有許多廠房跟土地，且這幾年不動產飆漲，導致不動產占比很容易達到房地合一2.0的標準，而落入課稅範圍，但是這種交易實質上並非出售不動產，部分只要是家族股權釋權因而交易行為，特定股權納入房地合一課稅，對透過法人持有房地產移轉或處分不動產帶來一定程度的影響，不利於擁有資產的中小企業。
此外，110年7月起實施股權交易適用房地合一2.0，含括交易日標的的所有房地，影響企業IPO與提升競爭力，不利企業永續經營，且有不溯及既往與信賴保護原則。
個人在104年以前所取得的不動產不適用房地合一2.0，但是若透過公司取得不動產，不論是104年以前或者是之後都適用，邏輯並不一致；另外，因為工作調動之故，需要出售持有未滿2年的不動產，也會被課徵高稅，也有違反稅務中立原則。
財政部回應，已經請各地稅國稅局蒐集此類股權交易，達到轉移房地目的，將應稅房地交易所得轉換為免稅的證券交易所得案件，並彙整稽徵實務適用的疑義，評估修正要點的必要性與合理性。