衛生福利部29日預告修正「傳染病防治法」部分條文，但對指揮中心退場機制卻付之闕如，前疾管局副局長施文儀直指，指揮中心遲遲不退場，是拿著疫情來壓迫老百姓，應將退場機制明訂在「傳染病防治法」中，避免用嚴刑峻法套住人民，該退場就退場，才能讓人放心。
為銜接明年6月30日結束的嚴重特殊傳染性肺炎防治及紓困振興特別條例，衛福部著手修正「傳染病防治法」。指揮中心宣布與病毒共存多時，邊境也已開放，但卻遲遲不退場。施文儀指出，政府應與各界共同討論，不該淪為一言堂，指揮中心該退場就退場。
另現行傳染病防治法第27條明定，疫苗基金中的捐贈收入「不得使用於指定疫苗之採購」，修正條文調整為「捐贈人指定採購疫苗者，不得指定疫苗之廠牌及種類」。中華民國防疫學會理事長王任賢質疑，每個疫苗廠牌的價格不一樣，哪有道理是只能捐錢，不能指定內容？
不過，施文儀則認為，過去王詹樣基金會捐贈肺炎鏈球菌疫苗均未指定廠牌，由政府依衛福部傳染病防治諮詢會建議採購，但新冠疫情期間民間單位指定捐贈BNT疫苗，可能讓執政者感覺「被架著走」，才會有此條文修正。他認為疫苗是專業問題，禁止指定廠牌的方向正確，可避免混亂的局面。
而修正條文第44條是針對第一到三類傳染病患者「於指定隔離治療機構或處所施行隔離治療」。王任賢認為加上「處所」二字是正確的，符合新冠肺炎確診者居家照護和集中檢疫所做法；但「指定」二字不妥，因為治療屬於地方權責，中央沒有指定的權利，應改為「地方政府認定或審定」。
國內第三波疫情持續延燒，昨新增2萬7220例本土個案，較上周五增加8255例、上升約43.5％；另新增193例境外移入個案、34例死亡。
而自明年1月1日0時至1月31日（航班表定抵台時間）止，搭乘自大陸4個直航航線，及金馬地區民眾春節交通專案之來台旅客，入境時須於機場（或港口）PCR檢測，桃園機場已在入境管制區內架設好採檢區，供旅客使用。