經濟部為擴大種電面積，近來積極在各地宣導，於水庫、埤塘架設太陽能面板，清大教授葉宗洸認為，此舉可能有汙染水源的疑慮。中央大學管理講座教授梁啟源則說，太陽能設備退役後恐成廢料，政府不能為了發展再生能源而忽略可能影響的災害，應該要提前防範。
嘉義縣大埔鄉公所規畫在曾文水庫發展太陽能光電，引發強烈反彈，縣議會已要求縣府不可同意任何單位在水庫上蓋太陽能，此案已暫停。但是根據經濟部資料顯示，從北到南，台灣的水庫已有多數被種電。
光電業者表示，太陽能光電板為了抗反射，會如車子擋風玻璃一樣去鍍膜，因此不能用化學藥劑去清洗，這與外界的印象不同，以清水定時沖洗，不會有汙染問題。
但是葉宗洸說，建置太陽光電從一開始生產面板，就可能產生有毒廢液，最近為拉高裝置容量，還打算在曾文水庫興建浮動式太陽光電，問題來了，以20年使用年限，未來遇上颱風等外力影響破損，封裝要用的醋酸乙烯酯跑到水裡，引發外界關切是否汙染水源？業者曾做實驗，將破掉的光電板放在水裡7天，但其實醋酸乙烯酯這種塑料在陽光照射下，長時間沒清理，就會汙染水源，業者7天實驗期太短。
葉宗洸擔心，支架使用的焊料常含六價鉻，這是有毒物質，長期泡在水中，也有汙染疑慮。
梁啟源表示，太陽能光電設備不僅引發熱島效應疑慮，還有光害問題、影響地質、漁業貝類死亡，過去有許多學者提出警告，政府在發展再生能源時，必須考慮這些隱憂。(中國時報/吳靜君、王莫昀、王玉樹)