政府採購高端疫苗過程備受質疑，在大選過後，衛福部疾管署長莊人祥16日表示，獲高端董事會同意後，提前對外公開高端合約內容，並首度揭露高端最初報價1劑950元，經疾管署爭取，才降為881元與810元等2種劑量價格，至於2020年所說1劑700元，是初步估計，並未包括冷鏈價格，疾管署絕未以較高價格採購高端疫苗。
國民黨新科立委廖偉翔說，民進黨政府拖到大選後才願意公開高端合約，合約裡恐還藏有極度不合理的事。待立院開議後，將持續追查881元的議價過程，並要求衛福部公開會議紀錄。
高端疫苗採購合約有無弊病，在大選前是朝野攻防的重點，雖然行政院表示願與高端溝通，盼提早公布合約，但拖至昨日，高端公司召開董事會，拍板決議解除5年保密限制，同意疾管署對外公開合約條款。
莊人祥表示，與高端簽訂的履約標共採購500萬劑疫苗，由於高端承諾將贈送20萬劑疫苗，因此總計採購480萬劑，金額40億3千萬元，相當於單劑型每劑881元、多劑型810元。
但是在2020年，疫情指揮中心曾說，高端1劑700元。相較於慈濟財報揭露捐贈BNT疫苗經費，每劑630元，衛福部被質疑高端疫苗買貴了。
莊人祥說明，當時指揮中心是以疫苗採購總經費115億元、採購1500萬劑去估算，得出每劑700元，且不含冷鏈及其他作業費用，「當時尚在規畫採購初期，各項資訊均不明確，僅能以預估價編列預算。」
至於2021年2至5月與高端議價期間，莊人祥說，高端原本每劑要價950元，經極力爭取，才降到平均840元，且配送點從20個擴增到200個，契約並增列廠商須負責冷鏈、冷藏、預防接種受害救濟基金一劑1.5元徵收金額。相對於莫德納、AZ等國際疫苗價格，都不包括冷運冷藏費用。
國健署前署長邱淑媞質疑，高端至今都沒有通過三期臨床試驗，卻能以相當於莫德納疫苗每劑867元價格賣給疾管署，至今也只能賣給台灣，「這樣的合約還要保密？簡直是全世界最荒誕的合約。」
不具名醫界人士推測，高端要保密的原料應為佐劑，因美國廠商有專利權，價格高昂，由於美國國家衛生院提供疫苗原型，或許高端需要支付權利金，但合約內並沒有這些內容，合理懷疑合約未完整公開。
廖偉翔也說，疾管署聲稱議價過程從950元降到881元，881元包含運送成本等，但報價單並未列出運送費用，881元如何算出來的，衛福部還是沒說清楚。
廖偉翔並說，高端合約上寫著「疫苗採購，爰免報上級機關派員監辦」，疾管署解釋是依《採購法》第105條「採購法霸王條款」，只要人民生命、健康遭遇緊急危難，就可不用依《採購法》規定，所以高端40多億元採購案免派員監辦，《採購法》霸王條款並非無限上綱，請衛福部說明清楚是否有派員監辦？如果沒有，決定採購案的簽核者是誰？（相關新聞刊A2）(中國時報/鄭郁蓁、張亦惠、洪凱音)