賴政府重大人事案已陸續公布，準總統賴清德曾自稱是務實的台獨工作者，國防部長顧立雄、可掌握警政署人事的內政部長劉世芳、掌管海巡署的海委會主委管碧玲均為獨派。軍、警與海巡同時掌握在獨派手中，是史上第一次。國家合法武力均由獨派掌舵，短期雖不致有變化，長期則有待觀察。不過，就軍隊而言，就是換個人敬禮，國軍的假想敵是中共，一致對外，軍中認為不會有變化。
劉世芳在立委任內，即曾主張修改陸軍官校校歌歌詞，希望將「黨旗飛舞」改為「國旗飛舞」，劉世芳到立法院國防委員會，有機會就對此質詢。520後，警政署人事權將在她手上，日後行事值得密切注意。
事實上，內政部長與警政署長的「部署之亂」，在前內政部長徐國勇與前警政署長陳家欽任內即發生過，陳家欽趕在退休的前1天，大爆徐國勇「塞名單」，「喬」警政署內部人事內幕。不過，徐國勇也絲毫不客氣回嗆：「笑死了，權力是我的，我何必喬我的人事？」
徐國勇與陳家欽這場「部署之亂」，不涉及意識形態，只是人事權責所屬的爭執，未來若將統獨意識形態延伸到警察任用，後果不堪想像。
此外，管碧玲也是獨派主張，這次處理金門海域的大陸漁船事件，已見立場。然而，海巡署長周美伍下台，代表賴政府退一步，有意解決金廈海域漁船爭端，但就像中共不承認海峽中線情況一樣，到嘴的肉，不會吐出來的，外離島海域爭議今後將更難處理。
準國防部長顧立雄更是強硬的抗中派，台獨立場鮮明，不過政黨輪替多次，軍隊早已中立，加諸兩岸軍事情勢嚴峻，軍人保家衛土，賴政府需要國軍盡責，應不致強以意識形態治軍。若硬要分化軍隊，對民進黨與獨派並無任何益處。(中國時報/呂昭隆)